Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms