Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms