Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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