Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM183BQ1AE95 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms