Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms