Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CTF1Q16619 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CTF1Q16619 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CTF1Q16619 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CTF1Q16619 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTF1Q16619 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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