Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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