Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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