Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA6Q16445 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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