Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK3Q16288 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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