Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA6Q15825 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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