Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms