Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TWIST1Q15672 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TWIST1Q15672 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TWIST1Q15672 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TWIST1Q15672 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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