Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms