Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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