Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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