Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRKQ15262 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
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