Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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BRD3Q15059 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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BRD3Q15059 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BRD3Q15059 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BRD3Q15059 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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