Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP1Q15025 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms