Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIN2CQ14957 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms