Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms