Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM25Q14258 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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