Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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