Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms