Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TUBA3CQ13748 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TUBA3CQ13748 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TUBA3CQ13748 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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TUBA3CQ13748 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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TUBA3CQ13748 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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