Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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