Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms