Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL1Q13616 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms