Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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NAE1Q13564 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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