Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PICALMQ13492 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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