Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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