Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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