Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF5Q13243 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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