Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPA4Q13156 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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