Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPS1Q13098 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPS1Q13098 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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