Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM32Q13049 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM32Q13049 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms