Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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