Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFX1Q12986 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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