Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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