Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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GTF3C1Q12789 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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GTF3C1Q12789 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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GTF3C1Q12789 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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GTF3C1Q12789 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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GTF3C1Q12789 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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GTF3C1Q12789 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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