Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 YAR060CYAR060C 336 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 ATG19YOL082W 1248 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YPL142CYPL142C 318 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 DNL4YOR005C 2835 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 NUP100YKL068W 2880 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YNL018CYNL018C 1839 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 DBF20YPR111W 1695 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 DAD4YDR320C-A 219 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 GPI19YDR437W 423 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 TDA10YGR205W 873 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 CSH1YBR161W 1131 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 GIP3YPL137C 3831 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 KAR1YNL188W 1302 nt2.42□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YJR098CYJR098C 1971 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 ALK2YBL009W 2031 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 MRPL32YCR003W 552 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 RGI1YER067W 486 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 ARG3YJL088W 1017 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 BOS1YLR078C 735 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 MST28YAR033W 705 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YIP3YNL044W 531 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YOL118CYOL118C 309 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YRO2YBR054W 1035 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 JID1YPR061C 906 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 ERV15YBR210W 429 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 ARP9YMR033W 1404 nt2.41□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 IRA2YOL081W 9240 nt2.4□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 snR78snR78 87 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YFH1YDL120W 525 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 SAE2YGL175C 1038 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 ERG25YGR060W 930 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 SAS2YMR127C 1017 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YNL046WYNL046W 519 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 RPL25YOL127W 429 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 CCL1YPR025C 1182 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YDR131CYDR131C 1671 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 TOR1YJR066W 7413 nt2.4□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 NOP56YLR197W 1515 nt2.39□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 SVL3YPL032C 2478 nt2.39□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YRB1YDR002W 606 nt2.39□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YGR050CYGR050C 357 nt2.39□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 RGL1YPL066W 1440 nt2.39□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 HSC82YMR186W 2118 nt2.39□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 HOS4YIL112W 3252 nt2.39□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 SWR1YDR334W 4545 nt2.38□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 snR76snR76 109 nt2.38□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 VMA10YHR039C-A 345 nt2.38□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 CLN3YAL040C 1743 nt2.38□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.38□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 snR35snR35 204 nt2.38□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 SSD1YDR293C 3753 nt2.38□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 FUS1YCL027W 1539 nt2.37□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 COG2YGR120C 789 nt2.37□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YGR293CYGR293C 462 nt2.37□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 PFS1YHR185C 714 nt2.37□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YJL202CYJL202C 348 nt2.37□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 CBP6YBR120C 489 nt2.37□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 DSE1YER124C 1722 nt2.37□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 TRA1YHR099W 11235 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 PIB1YDR313C 861 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 DLT1YMR126C 1029 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YBL062WYBL062W 381 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 ICS2YBR157C 768 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YBR209WYBR209W 318 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 AI4Q0065 1671 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YGL176CYGL176C 1665 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 KOG1YHR186C 4674 nt2.36□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 PLP1YDR183W 693 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 GIC2YDR309C 1152 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YMR31YFR049W 372 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 RPF2YKR081C 1035 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 MRPS8YMR158W 468 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 MER1YNL210W 813 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 UFE1YOR075W 1041 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 PET20YPL159C 762 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 ALG14YBR070C 714 nt2.35□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 ATP3YBR039W 936 nt2.34□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 snR191snR191 274 nt2.34□□□□□ -2.03
TY3A-GQ12173 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 FUS2YMR232W 2034 nt2.34□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 ARP7YPR034W 1434 nt2.34□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 RLF2YPR018W 1821 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 HRD3YLR207W 2502 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 ART10YLR392C 1557 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 TIM9YEL020W-A 264 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 GEP7YGL057C 864 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YHL044WYHL044W 708 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 FSH1YHR049W 732 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 PET191YJR034W 327 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 MET14YKL001C 609 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 MRP49YKL167C 414 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 HYM1YKL189W 1200 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 RNP1YLL046C 750 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 MRPL40YPL173W 894 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 COG3YER157W 2406 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YRR1YOR162C 2433 nt2.33□□□□□ -2.04
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