Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms