Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms