Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP300Q09472 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EP300Q09472 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EP300Q09472 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EP300Q09472 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EP300Q09472 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EP300Q09472 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EP300Q09472 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EP300Q09472 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EP300Q09472 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
EP300Q09472 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EP300Q09472 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EP300Q09472 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EP300Q09472 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms