Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGM3Q08188 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms