Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms