Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDSPL2Q05D32 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDSPL2Q05D32 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms