Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 RPL11BYGR085C 525 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 PCL5YHR071W 690 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RNR2YJL026W 1200 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ERG29YMR134W 714 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YNL203CYNL203C 612 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 CSI2YOL007C 1026 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RPL11AYPR102C 525 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RIF1YBR275C 5751 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YDR338CYDR338C 2088 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 PBP4YDL053C 558 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RSM18YER050C 417 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 MIC19YFR011C 513 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 MND1YGL183C 660 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 Q0144Q0144 330 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YHR054CYHR054C 1065 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SYS1YJL004C 612 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 MBB1YJL199C 327 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ATG38YLR211C 681 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 NTC20YBR188C 423 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ICR1ICR1 3199 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YCT1YLL055W 1596 nt2.47□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SKT5YBL061C 2091 nt2.46□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ARK1YNL020C 1917 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 RPO41YFL036W 4056 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 RSE1YML049C 4086 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 ASI3YNL008C 2031 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YET1YKL065C 621 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 MRPL38YKL170W 417 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 VPS63YLR261C 327 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 ECI1YLR284C 843 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 CAT5YOR125C 702 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SEC66YBR171W 621 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 IKI3YLR384C 4050 nt2.46□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 VPS64YDR200C 1815 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 ESL2YKR096W 3588 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SNO3YFL060C 669 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 RPS16AYMR143W 432 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 GIM3YNL153C 390 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SNO2YNL334C 669 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 MRD1YPR112C 2664 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 GIN4YDR507C 3429 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 STI1YOR027W 1770 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YCK2YNL154C 1641 nt2.45□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 ARP8YOR141C 2646 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YKL100CYKL100C 1764 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 BIT61YJL058C 1632 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SNA4YDL123W 423 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 RPL17BYJL177W 555 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 PRP21YJL203W 843 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 ECM9YKR004C 1134 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 RPL23AYBL087C 414 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YOL029CYOL029C 606 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 MIX23YBL107C 591 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YOR331CYOR331C 558 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YBR062CYBR062C 543 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YPL276WYPL276W 438 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YNL193WYNL193W 1677 nt2.44□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 ESC1YMR219W 4977 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 TCB2YNL087W 3537 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 AVT2YEL064C 1443 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 snR5snR5 204 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YGR017WYGR017W 894 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 PRP38YGR075C 729 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 ASG7YJL170C 630 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 VMA6YLR447C 1038 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YMR181CYMR181C 465 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 NMA111YNL123W 2994 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 NGL1YOL042W 1092 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YOR055WYOR055W 435 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 VPS30YPL120W 1674 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 PDR1YGL013C 3207 nt2.43□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 NUM1YDR150W 8247 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SHS1YDL225W 1656 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 DAD1YDR016C 285 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YIL082WYIL082W 873 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 CDC123YLR215C 1083 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 AIM36YMR157C 768 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 RRT16YNL105W 429 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SGT1YOR057W 1188 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YPR147CYPR147C 915 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SLH1YGR271W 5904 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 TFB1YDR311W 1929 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 MED1YPR070W 1701 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 SMC2YFR031C 3513 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YLR446WYLR446W 1302 nt2.42□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 YEL1YBL060W 2064 nt2.41□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 PCK1YKR097W 1650 nt2.41□□□□□ -2.02
YHC1Q05900 NET1YJL076W 3570 nt2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.7 ms