Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKCDQ05655 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCDQ05655 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms