Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCZQ05513 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCZQ05513 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms